金华山为道家三十六洞天之一，在历史上就是修道之人游历或修行之所。其中比较有名的是东汉时期的皇初平。根据东晋葛洪写的《神仙传》记载，皇初平是丹溪人。十五岁时，他放羊时遇见一位道士。道士见他善良谨慎，就把他带到浙江金华山的山洞里去修炼，一去四十多年，他也不再念家。初平的哥哥皇初起，见弟弟放羊不归，就進山寻找，找了多年都没找到。

后来，初起在集市遇见了一个道士，就向他打听初平的下落。道士说：“金华山中有一个牧羊童，姓皇字初平，是你弟弟无疑了。”初起于是就跟随着道士，来到金华山里见到了失散了四十多年的弟弟。兄弟俩相见，悲喜交加，诉说着离情。初起问初平他放的羊是否还在，初平说，“就在东边山坡上。”初起就到东山坡上去看羊，没有一只羊的影子，只见一堆白石头。就回来对初平说，“我在东山坡上没见到有羊啊？”初平就与哥哥一道来到东山坡。初平吆喝了一声：“羊起来吧！”转眼之间，那些白石头变成了几万头羊。初起惊诧之余，开始向弟弟学道。后世用的成语“叱石成羊”就是源于这一典故。

修到五百岁时，他们坐在那里，身体能够突然从这个空间消失，大白天走路，见不着影子，面容也长的像孩子一样。初平后改名为赤松子，初起改名为鲁班。后来兄弟俩双双在此成仙。

自皇氏二仙后，有诸多道士在此修行，如后晋著名道士非丘子；亦有修佛之人在此静修。比如《神僧传》记载，南朝高僧释慧约就曾来到金华山修行。慧约十六岁时出家为僧，十七岁拜慧静为师，跟随他住在剡州的梵居寺。慧静圆寂后，慧约继续在此修炼，后来不再吃粮食。南朝齐太宰文简公褚渊，遇疾白天睡觉作梦，梦见有天竺僧人说：“菩萨当至。”于是他派人寻找有德行的人。不久，慧约来到，褚渊的病立即就好了，因此请受五戒。

后来，慧约来到金华山修行，有时停留在赤松涧。当时有个叫丁德静的道士，在居所暴亡。人们传说，是为山精所杀。长山令徐伯超马上请慧约移居于此，不久神魅弭息。后来慧约白天静卧时，见二青衣女子从涧水中出来，行礼后忏悔说：“因为夙障深重，堕此为水精，昼夜烦恼。”慧约立即为她们授以归戒，自此该地的灾怪永绝。

大同元年八月，慧约涅槃，异香满室。涅槃前，他对弟子们说：“我梦见四部大众，幡花罗列，空中迎我，凌云而去。福报当讫。”

因为有众多的仙家在此修行，自然有很多仙迹的存世。

皇氏二仙当年生活过的洞穴后被称为“二仙洞”。洞口海拔373米，洞内有石花、石笋、石钟乳、石幔、瀑布等，其中“黄帝散花”(金华名称的由来)、“群羊迎客”、“轩辕宝伞”、“兄弟相聚”、 “初起角尺”、“二仙笔架”、“二仙棋盘”、“水晶宫”、“二仙梯田”、“大仙花生”、“金华佛手”、“七龙仙瀑”等景观，从名称就可以看出，充满了仙家之气。此外，金华山上与二仙有关的仙物和仙迹多达100多处。

离“二仙洞”200米左右的地方是双龙洞。其洞口海拔为520米，洞口右面有一条青色龙状钟乳石，有鳞有爪，形象逼真；左侧则有一条黄色钟乳石，呈俯伏状，因此该洞被称为“双龙洞”。洞有内洞和外洞之别，外洞已是钟乳林立，惟妙惟肖；走入内洞，则宛如置身仙境龙宫，钟乳石、石笋、石幔、石柱、石钟、地下泉水众多，似乎在将龙宫的奇珍异宝悉数展出，什么“仙人挂衣”、 “仙人床”、“倒挂蝙蝠”、“彩云追月”、“天马行空”、“海龟探海”等景观令人目不暇接。其面积约为2100平方米。

从双龙洞穿越一条百米长的地下河，就来到了洞口小、肚大、洞深，内有飞瀑，形似冰壶的“冰壶洞”，真是“一瀑垂空下，洞中冰雪飞”。其洞口海拔约580米，从洞口至洞底筑有石阶260 余级，盘曲通达洞底。洞中遍布的石笋、钟乳石是千姿百态，动人心魄。

出冰壶洞由东向西而上约一公里，即为朝真洞。它又名真人洞，据传洞内曾有石真人。朝真洞海拔为887米，洞口向西，前临深壑，背依青峰，洞前眺望只见四周芙蓉、鹿田诸峰挺立，宛若百僧朝圣求真，因而得名。除此而外，还有景观奇特、洞中瀑布落差达73米、堪称世界之最的仙瀑洞，传说是仙人皇初平拯救百姓逃避灾难之地。

1996年，今人在鹿田湖东侧修建了黄大仙祖宫，以纪念皇氏二仙。

南朝梁时的文人沈约曾作《游金华山》一诗，赞美了金华山的仙家气派，诗曰：