石竹山，素有“雅胜鼓山”之誉，是历代道家方士寻仙、修道之山，并被人们视为“神窟仙宅”、“灵异之府”。

大概在汉代，就有人在石竹山上修炼。根据史料，“何九仙世传兄弟九人，居于山修道，又居九鲤湖侧炼丹，丹成，各乘鲤仙去”。清代《福清县志·地舆志》记载，五代后梁时“林真人炼丹于此，丹成骑虎上升”。《闽都别记》第101回载：“福清石竹山之仙人林汝光，在石竹山修炼，骑虎上升。他好度凡人，仙游浙江宁波，收余心发为徒，带回福州，师徒二人路费用完，分文皆无。林汝光就带心发来到屏山，指着一池塘，将满塘池水变成白银，又到南门池浦堤岸，变池水为“银镶浦”与“金堆洋”。林汝光还把金银用不完的秘袂告诉了心发。有了金银，心发萌发了思凡之心，要求回家。林汝光知其俗骨难以度化，就同意让其回乡。心发急往池塘取银，可是却怎么搬也搬不动，最后只拿下了二两而已。后来还有唐代真人郑文叔等在此修炼。

石竹山的宫观应该是建筑在半山腰西侧悬岩峭壁上的仙君楼，至于它建于何时，已经无从查考。它供奉的是何氏九仙，应该在唐以前或唐初。建于唐朝大顺二年（891年）的灵宝观是供奉林真君的。《福清县志•人物志•仙释》载：“林炫（玄）光，邵武人，朱梁时尝炼丹于石竺山，后舍宅为仙井寺，以产业入灵宝观。”石竺山即为石竹山。灵宝观后更名为灵宝道观。不过，在宋绍圣二年，灵宝道观被移至玉融山，曾兴盛一时，但不再属于石竹山。

唐时，佛教亦开始在石竹山兴起，南宋时，進入鼎盛发展时期。宋端平二年（1235），進士林希逸写的《石竺山二十咏》组诗之序明确指出：“（石竺）山在福清境内，昔羽人、今纳子居之。”“衲子”即僧人。说明当时在山上的僧人多过修道之人。最早建造的佛教寺院是石竺院，始建于唐大中元年（847年），后更名为石竹寺，由九仙阁、玉皇殿、伽蓝殿、文昌阁、土地庙、观音堂、石佛宫等组成。明末清初式微。

虽然佛、道在石竹山上并存，而且在南宋时佛教发展超过道教，但到了南宋后期，出现了祈梦灵地之说，应该还属于道教范畴。据说何氏九子成仙后，人们在此立庙奉祀，祈梦十分灵验，特别是关于功名方面的。南宋宝佑的《仙溪志》引陈谠的《梦记》，记叙了五、六位科第祈梦应验的故事。到了明朝，石竹山祈梦之灵验更是远近闻名。明代王世懋在《闽部疏》中记载：“福清县石竹山，亦有九仙灵迹，其山亦宏丽，在宏路驿大道旁，士人祈梦者，以秋往九鲤湖，以春往石竹山。石竹山是九仙离宫，为行春治所耶。”

据明何乔远《闽书》卷石竹山条云：“皇朝邑人叶向高为孝廉时，祈梦，梦人语之日：‘腰系白玉带’，后果验。”叶向高后为内阁首辅。万历四十五年（1617），他再次游石竹山时，亲自对友人叙述梦见有人语之日：“腰系白玉带”，并作诗《登石竹岩》。诗云：

石竹山不仅山峰嶙峋、峻峭，如紫磨、狮子、象王、状元、龙女诸峰，而且奇石、幽洞甚多，如紫云洞、桃源洞、通天洞、日月洞、摘星台、化龙窝、鹤影石、蓬壶石、鸳鸯石、棋盘石、龟蛇石、蟠桃石、穴窦、洞天等。在这其中，自然留有许多仙迹，比如紫云洞，是五代林真人炼丹处；虎迹岩是林真人骑着老虎白日飞升之处。仙游的仙门洞，传为何九仙所居之处。

关于林真人和何氏九仙，石竹山一带还流传着他们扶危济贫的故事。

传说五代闽国时，有一名为周艳冰的书生之未婚妻吴瑶琴，为闽王抢入后宫为宫女。林真人有心相助，就化成满身生疮的叫化子，并以身上的疮虫塞入艳冰口中。艳冰恶心，口吐一纸，内有字日：艳冰汝莫泣，石竹有仙迹；若要求瑶琴，西山出红日。周艳冰这才知道叫化子是仙人，乃進石竹山求仙，又碰见了林真人。林真人领着他来见九仙真，其中一个道人赠给艳冰一封锦囊，并说：“随存在身，至急迫时开看，自然夫妇相逢。”后来周艳冰用锦囊中的“追魂丹”救活吴瑶琴，夫妇团圆。

还有“石竹山飞瓦”的故事。据说多智和尚因建寺无人运瓦而发愁时，竟迷迷糊糊做起梦来，结果何氏九仙显灵，瓦片奇飞。“出米石”讲的是山民黄阿山家中贫苦，祖母挨饿，忽梦见石竹山上的石木皇里尽是白米，梦醒后到山上一看，果然如此。此外，《龙女峰的传说》、《鸳鸯石的传说》、《林汝光的传说》、《鲤鱼山》等传说也是仙气十足。

石竹山还有海市蜃楼等奇特的景观。明末福州著名诗人曹学全曾作《登石竹山》一诗，将雄伟、庄严、神异的石竹山呈现在人们面前，诗云：