巍山是云南著名的道教名山。早在东汉时期，张道陵天师创立的五斗米道就曾传入巍山。三国时期，孟获的兄长孟优得到异人传授的仙书，在巍山隐居修行，后以方术济人。《新纂云南通志・释道传》载：“汉，孟优，蒙化人，居巍宝山，土帅孟获兄也。素怀道念，常往来澜沧、泸水间，得异人长生久视方药诸书，随处济人。后主建兴三年，诸葛亮南征，军中误饮哑泉，辄手足四禁不语，或谓优有良药，使人往求之。优進仙草立验，亮惊异之，与语人：天运会深有契。后入峨眉山，不知所终。其子孙于元时，赐姓孟。”根据现存资料，巍山道教在唐朝时兴起。唐初，洱海地区出现“六诏”，其中的蒙舍诏在巍山境内，而且在五诏的南部，所以又称“南诏”。《巍宝山志》记载，太上老君降临巍山，点化细奴罗，告诉他将成为南诏王。在其死后，还将他封为巍山的巡山王。此后，巍山道教开始发展。唐朝著名道士杜光庭曾来此修炼，并写了《南诏德化碑》。唐末五代八仙之一的吕洞宾也曾来到巍山传道。

明清时期，巍山道教走向兴盛，众多道士来此修行，如沈妙章、陈道体、李法纪、杨法印、毛法升、杨法荫、杨阳合、杨阳慧、李载奇、陈永林、刘志法、郑心元等。《云南通志》卷二十五记录了一些道士的故事。比如明朝的王旻，四川华阳人。永乐初年，在蒙化居住时，遇到异人传授其道术。学后，他能役使鬼神，召唤风雨。当时邓川有一条恶龙作祟，人们请王旻前往驱恶。王旻来到后，恶龙遁去。成化十年，他预先知道了自己坐化的日子，告诉了大家。到了那一天，他果然仙去。蒙化人都认为他尸解成仙了。还有清代的知名道士何太和、冯应魁也在巍山隐居修行。史料记载，鼎盛时期住山道士多达数百人。

唐之前，巍山中已经建有山神庙、龙王庙等庙宇，宫观则自唐开始修建，唐代南诏王族的后裔们在山上修建了老君殿；明清时则开始大量建造宫观，至清末，道教殿宇已然遍布全山，多达二十余所，其中历史最为悠久的是悬珠观。它“创自蒙诏，明成化（1465～1487）间拓建，为近城诸刹之冠”；观内有关圣殿、玉皇阁、三官殿、天王殿、吕祖殿、财神殿、天师楼等建筑。民国时期，因为和与其相邻的另一佛寺联通，故又称玄龙寺。此外，著名的宫观还有准提阁、巡山殿、文昌宫、青霞观、玉皇阁、培鹤楼、含真楼、元极宫、云鹤宫、道源宫等。建于明代的青霞观内有《重修巍山青霞观碑记》，云：此地是道教始祖太上老君降化细奴罗之所。建于乾隆时期的培鹤楼，是祭祀吕洞宾之所。其为一巍峨壮观的大殿，内奉吕纯阳祖师，泥像身披绿袍八卦衣，头戴方巾帽，身后塑有两只仙鹤，传说这两只仙鹤是建盖培鹤楼时从地基上飞出。

除了道士在巍山上修炼外，还有僧人亦在此修行。唐代中期，佛教传入巍山，并建造了观音殿、甘露亭等寺院。

巍山除了与修炼有关而留下的“巍宝仙踪”外，还有八大自然胜景，即拱城远眺、天门锁胜、美女瞻云、龙池秋月、山茶流红、鹤楼古梅、朝阳育鹤和古洞长春。此外，每年农历二月十三日至十五日的巍山歌会， 是彝族青年男女的狂欢节。

清张端亮有诗赞美了巍山的自然和人文景观：